白蚁每次脱皮，肠内的共生微生物也随脱皮而丧失。为此，必须与群体内的其他个体保持密切联系，通过互相喂食或吞食其他个体排出的分泌物，而重新获得肠内共生的微生物。只有重新获得共生物后，才能进行正常的代谢作用。美国学者用电子显微镜研究了散白蚁肠内共生的五个属鞭毛原生动物，发现这些鞭毛虫的表面膜上有一种原核生物附着，主要是螺丝体和杆状细菌，没有细胞核结构的低等生物包括蓝绿藻、细菌、立克次氏体、黏菌、螺丝体等。鞭毛虫和原核生物组成一体，有消化纤维和固氮能力，因此.白蚁肠内原生动物，可能不能直接消化纤维素，而是原核生物帮助原生动物消化纤维素。