发酵工业生产具有反应条件温和、生产原料来源广泛、价格低廉以及与其他工业相比投资少、见效快、经济与社会效益显著等诸多优点。而且，通过发酵工程技术生产的产品种类多、应用面广。因此，发酵工程具有广阔的发展应用前景。

　　近年来，生物技术的迅速发展有力地推动了发酵工程技术的发展，而发酵工程技术的应用则是直接将生物技术转化为生产力，用于生产人类所需的各种产品并成为服务社会的重要手段。因此，基因工程、细胞工程以及酶工程技术的最终实施主要是依靠发酵工程技术来完成的。所以现代发酵工程是生物技术的重要内容之一，是生物技术实现产业化的必由之路，是未来经济社会发展过程中富有生机和活力的一个重要产业群体。

　　目前发酵工程技术的研究主要集中在如下几个方面。
　　（1）采用基因工程、细胞工程技术与常规微生物育种方法相结合的手段，辅之以激光、离子束、Y射线等物理诱变方法，致力于选育发酵工业所需的各种优良生产菌种。
　　（2）大规模工业化发酵生产技术。
　　（3）开发研制社会需要、附加值高的新型发酵产品。
　　（4）研究开发发酵和提取新技术、新工艺、新设备，提高产品收率，节能降耗。
　　（5）采用发酵工程技术取代部分传统化工产品的生产，降低原材料消耗和能源消耗，减少污染物的排放。