2000年6~9月，白龟山水库流域降雨量为1180.3mm，较多年平均值偏高118%；库水位最高时达103.36m，最低时为97.65m(死水位97.50m）。由于水库大坝区处在除险加固阶段，要求库水位不能超过101.00m，再加上水库多年来一直处于干旱季节，因此库水位一直处于回落状态。2000年汛期库区遭遇了近20年来罕见的大雨，致使库水位猛涨，泄洪闸频繁开启泄洪。据统计,6、7、8月三个月流域平均降雨量940mm，入库水量15.81亿m，防洪弃水13.89亿m，泄洪闸最大泄量达1500 m/s，仅次于1975年的3300m/s，期间最大日降雨量达256mm。

　　因暴雨强度大、历时长，水库工程多处遭遇险情，坝坡出现渗水、集中漏水、塌坑等。7月4日雨中检查时,在桩号顺河坝10+000处发现塌坑一处，其面积达40多m²，由于当时正值大汛,库水位较高(102.77 m),降雨强度又比较大,不便开挖,因此只做了临时的紧急处理，并在邻近的另一小塌坑内挖出白色蚂蚁，其数量之多是非常罕见的。由于当时水库技术人员对白蚁并不了解，只是听说有白蚁存在，对其形态未亲眼见过，再加上也无这方面的资料和书籍，因此水库便派技术人员将挖出的标本送往河南省水利厅，让有关专家进行鉴定，通过鉴定最终确定为白蚁。至此白蚁成为白龟山水库堤坝重大隐患之一，也是白龟山水库大坝管理维护的新课题。